基礎醫學院的前身是1963年成立的華北煤炭醫學院基礎醫學部，2010年華北煤炭醫學院與河北理工大學合并組建河北聯合大學后，經學科機構調整更名為河北聯合大學基礎醫學院，2015年學校改名為華北理工大學，隨之更名為華北理工大學基礎醫學院。

基礎醫學院是學校教學的主體部門之一，承擔著學校醫學各相關專業本科生、研究生和留學生的基礎醫學課程的教學任務。學院設有人體解剖學與組織胚胎學、病理學與病理生理學、病原生物學與免疫學3個學科，藥理學、生理學2個教研室和1個中心實驗室。經過多年的建設與發展，已形成較為完整的本科生和研究生培養體系，學科優勢明顯，擁有1個省級重點發展學科（病理學與病理生理學），3門省級精品課程（組織胚胎學、病理學、病理生理學），1個省級優秀教學團隊（基礎醫學形態學教學團隊）。

學院研究生教育始于1985年，與北京第二醫學院聯合培養碩士研究生。1993年，病理學與病理生理學獲得碩士學位授權；人體解剖與組織胚胎學、病原生物學分別于2001年和2003年獲得碩士學位授予權；2006年掛靠延邊大學招收博士研究生。2011年，基礎醫學一級學科新增為碩士學位授權學科。

學院擁有一支教學科研能力強、學歷層次較高，結構合理的高素質學術隊伍。其中有河北省教學名師、河北省有突出貢獻的中青年專家1人，河北省優秀教師1人，河北省醫學教育優秀教師8人，河北省“三三三人才工程”（第三層次）人才7人，唐山市勞動模范3人；擔任省級以上各學會理事、常務理事、副理事長者6人。

學院長期以來秉承“為煤炭行業服務、為礦工造福”的辦學宗旨，積極開展科學研究，先后承擔并完成了多項國家科技攻關項目、國家自然基金課題和省部級重點項目，在煤工塵肺發病機制研究、塵肺抗纖維化防治、大容量肺灌洗治療煤工塵肺等方面取得豐碩成果，出版了國內第一部《煤礦塵肺病理學圖譜》、參與了《塵肺病理診斷標準》（GB8783-88）制訂，建立起國內第一家煤工塵肺病理標本庫，為煤工塵肺防治和提高煤礦工人健康水平作出了突出貢獻。塵肺纖維化發病機理與防治研究已成為本院的特色優勢研究方向，部分研究成果達到國際先進水平。

學院現有臨床醫學、麻醉學、醫學影像學、醫學檢驗學4個本科專業，承擔全校各醫學相關專業本科生和留學生的基礎醫學課程的教學任務；基礎醫學一級學科為碩士學位授權學科，并掛靠延邊大學聯合招收博士研究生。學院始終把教育教學質量視為生存與發展的生命線，以夯實基礎為核心，以教育教學改革為動力，以提高學生創新能力和綜合素質為目標，積極進行教育教學改革的探索與實踐，形成了“基礎扎實，創新力強”的人才培養特色，所培養的畢業生大多已成為所在單位的學術帶頭人和學術骨干，受到用人單位的普遍好評。近年在與延邊大學聯合培養博士研究生的過程中，積累了寶貴的博士研究生培養經驗。

學院積極開展多種形式的學術交流與合作。定期舉行學術活動，邀請國內外知名專家介紹前沿學術研究動態和研究成果。與美國、英國、日本、匈牙利等國的多個科研機構建立了友好關系，定期選派中青年骨干教師前往進修學習。

學院擁有一個中心實驗室，下設形態、機能、解剖、病原生物四個分室。煤礦創傷基礎研究、生物技術研究與開發兩個實驗平臺，在科學研究和研究生培養過程中發揮著重要作用，已成為我院研究生培養和高水平研究工作的重要基地。